MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 33930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	ACG	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816612
2	NC_017470	GC	3	6	89	94	0 %	0 %	50 %	50 %	385816612
3	NC_017470	A	7	7	156	162	100 %	0 %	0 %	0 %	385816612
4	NC_017470	TAC	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816612
5	NC_017470	AAC	2	6	370	375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816612
6	NC_017470	TTTA	2	8	506	513	25 %	75 %	0 %	0 %	385816612
7	NC_017470	GCAA	2	8	551	558	50 %	0 %	25 %	25 %	385816612
8	NC_017470	TGC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816612
9	NC_017470	AGT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
10	NC_017470	TA	3	6	603	608	50 %	50 %	0 %	0 %	385816612
11	NC_017470	TTA	2	6	634	639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816612
12	NC_017470	A	6	6	647	652	100 %	0 %	0 %	0 %	385816612
13	NC_017470	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816612
14	NC_017470	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	385816612
15	NC_017470	AAG	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816612
16	NC_017470	TTC	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816612
17	NC_017470	TA	3	6	775	780	50 %	50 %	0 %	0 %	385816612
18	NC_017470	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
19	NC_017470	TCTG	2	8	836	843	0 %	50 %	25 %	25 %	385816612
20	NC_017470	CTC	2	6	889	894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385816612
21	NC_017470	GAA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816612
22	NC_017470	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
23	NC_017470	CTA	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816612
24	NC_017470	A	7	7	1114	1120	100 %	0 %	0 %	0 %	385816612
25	NC_017470	TCA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
26	NC_017470	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
27	NC_017470	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
28	NC_017470	AAAG	2	8	1871	1878	75 %	0 %	25 %	0 %	385816613
29	NC_017470	AGT	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816613
30	NC_017470	AAT	2	6	1937	1942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816613
31	NC_017470	CAT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
32	NC_017470	T	6	6	2078	2083	0 %	100 %	0 %	0 %	385816613
33	NC_017470	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
34	NC_017470	ATT	2	6	2216	2221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
35	NC_017470	CCGA	2	8	2345	2352	25 %	0 %	25 %	50 %	385816613
36	NC_017470	ACGC	2	8	2420	2427	25 %	0 %	25 %	50 %	385816613
37	NC_017470	CAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816613
38	NC_017470	AGA	3	9	2515	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
39	NC_017470	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816613
40	NC_017470	TCA	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
41	NC_017470	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
42	NC_017470	TTA	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
43	NC_017470	TAT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816614
44	NC_017470	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385816614
45	NC_017470	AGC	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816614
46	NC_017470	A	7	7	3107	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	385816614
47	NC_017470	ATTT	2	8	3301	3308	25 %	75 %	0 %	0 %	385816615
48	NC_017470	T	6	6	3306	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	385816615
49	NC_017470	AAT	2	6	3337	3342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816615
50	NC_017470	AATT	2	8	3350	3357	50 %	50 %	0 %	0 %	385816615
51	NC_017470	TTA	2	6	3382	3387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
52	NC_017470	A	6	6	3438	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	385816615
53	NC_017470	A	6	6	3448	3453	100 %	0 %	0 %	0 %	385816615
54	NC_017470	AGCAA	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	385816615
55	NC_017470	ATTTT	2	10	3514	3523	20 %	80 %	0 %	0 %	385816615
56	NC_017470	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
57	NC_017470	AGA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
58	NC_017470	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
59	NC_017470	AAGGC	2	10	3680	3689	40 %	0 %	40 %	20 %	385816615
60	NC_017470	CGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385816615
61	NC_017470	ATC	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816615
62	NC_017470	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816615
63	NC_017470	ACT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816615
64	NC_017470	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816615
65	NC_017470	GCA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816615
66	NC_017470	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816615
67	NC_017470	GTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816615
68	NC_017470	CTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816615
69	NC_017470	TTA	2	6	4199	4204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
70	NC_017470	AAG	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
71	NC_017470	GGAGAA	2	12	4287	4298	50 %	0 %	50 %	0 %	385816615
72	NC_017470	A	6	6	4339	4344	100 %	0 %	0 %	0 %	385816616
73	NC_017470	GGT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
74	NC_017470	GTAT	2	8	4424	4431	25 %	50 %	25 %	0 %	385816616
75	NC_017470	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816616
76	NC_017470	ACGA	2	8	4496	4503	50 %	0 %	25 %	25 %	385816616
77	NC_017470	CCA	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816616
78	NC_017470	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
79	NC_017470	A	6	6	4601	4606	100 %	0 %	0 %	0 %	385816616
80	NC_017470	GTC	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
81	NC_017470	TTC	2	6	4640	4645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816616
82	NC_017470	CGG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816616
83	NC_017470	TGGCGG	2	12	4662	4673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385816616
84	NC_017470	GGT	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
85	NC_017470	GTT	2	6	4714	4719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816616
86	NC_017470	AAG	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
87	NC_017470	GATGA	2	10	4804	4813	40 %	20 %	40 %	0 %	385816616
88	NC_017470	GAC	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816616
89	NC_017470	GGT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
90	NC_017470	AAG	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
91	NC_017470	TGA	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
92	NC_017470	CTAT	2	8	5081	5088	25 %	50 %	0 %	25 %	385816616
93	NC_017470	AAC	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
94	NC_017470	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816616
95	NC_017470	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
96	NC_017470	CTG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
97	NC_017470	GCTG	2	8	5580	5587	0 %	25 %	50 %	25 %	385816616
98	NC_017470	ACA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
99	NC_017470	TCG	2	6	5627	5632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
100	NC_017470	GGT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
101	NC_017470	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816616
102	NC_017470	CAAGG	2	10	5974	5983	40 %	0 %	40 %	20 %	385816616
103	NC_017470	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
104	NC_017470	ACT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816616
105	NC_017470	AGT	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
106	NC_017470	AAC	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
107	NC_017470	AAC	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
108	NC_017470	AGG	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385816616
109	NC_017470	ATG	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
110	NC_017470	CTT	2	6	6346	6351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816617
111	NC_017470	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816617
112	NC_017470	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
113	NC_017470	TTG	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
114	NC_017470	CCAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	0 %	75 %	385816617
115	NC_017470	TCA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
116	NC_017470	ATTT	2	8	6539	6546	25 %	75 %	0 %	0 %	385816617
117	NC_017470	GTTG	2	8	6589	6596	0 %	50 %	50 %	0 %	385816617
118	NC_017470	TGA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
119	NC_017470	GAT	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
120	NC_017470	AGT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
121	NC_017470	CTTG	2	8	6781	6788	0 %	50 %	25 %	25 %	385816617
122	NC_017470	TTA	2	6	6855	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816617
123	NC_017470	TGA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
124	NC_017470	CTA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
125	NC_017470	TGA	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
126	NC_017470	GTT	2	6	7007	7012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
127	NC_017470	ATC	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
128	NC_017470	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
129	NC_017470	GTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
130	NC_017470	AAC	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816617
131	NC_017470	TTG	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
132	NC_017470	CAC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816617
133	NC_017470	TAC	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
134	NC_017470	AAG	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
135	NC_017470	TGT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
136	NC_017470	CA	3	6	7413	7418	50 %	0 %	0 %	50 %	385816617
137	NC_017470	ACA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816617
138	NC_017470	CAT	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
139	NC_017470	TGA	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
140	NC_017470	AGAA	2	8	7666	7673	75 %	0 %	25 %	0 %	385816617
141	NC_017470	GTT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
142	NC_017470	CGAAGA	2	12	7768	7779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385816617
143	NC_017470	TTGA	2	8	7781	7788	25 %	50 %	25 %	0 %	385816617
144	NC_017470	GTG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816617
145	NC_017470	AAG	2	6	7988	7993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
146	NC_017470	AGT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
147	NC_017470	GAT	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
148	NC_017470	ACT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
149	NC_017470	GTG	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816617
150	NC_017470	CAT	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
151	NC_017470	TAC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
152	NC_017470	TAA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816617
153	NC_017470	CAT	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816618
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155	NC_017470	GGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816618
156	NC_017470	CGT	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816618
157	NC_017470	CTG	2	6	9164	9169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816618
158	NC_017470	TAATTT	2	12	9256	9267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816618
159	NC_017470	TTG	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816619
160	NC_017470	TAC	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816619
161	NC_017470	GA	3	6	9430	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	385816619
162	NC_017470	CAG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816619
163	NC_017470	ATA	2	6	9551	9556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
164	NC_017470	GTT	3	9	9586	9594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816619
165	NC_017470	TGG	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816619
166	NC_017470	AAT	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
167	NC_017470	ATA	2	6	9674	9679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
168	NC_017470	AAT	2	6	9706	9711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
169	NC_017470	AAT	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
170	NC_017470	AAT	2	6	9739	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
171	NC_017470	AAT	2	6	9754	9759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
172	NC_017470	TGA	3	9	9804	9812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816619
173	NC_017470	CAA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816620
174	NC_017470	AGA	2	6	9866	9871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816620
175	NC_017470	CGT	4	12	9878	9889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816620
176	NC_017470	CGT	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816620
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178	NC_017470	T	6	6	10267	10272	0 %	100 %	0 %	0 %	385816621
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261	NC_017470	TCT	2	6	15036	15041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816624
262	NC_017470	AAG	2	6	15074	15079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816624
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264	NC_017470	AAG	2	6	15158	15163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816624
265	NC_017470	AAG	2	6	15209	15214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816624
266	NC_017470	GGC	2	6	15323	15328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816624
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387	NC_017470	TTG	2	6	22701	22706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816635
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391	NC_017470	AAT	2	6	22770	22775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816635
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496	NC_017470	GGTA	2	8	28461	28468	25 %	25 %	50 %	0 %	385816640
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